STTB Ambon berawal dari dibukanya Sekolah Teologia Pratika Ambon (STPB Ambon) yang didirikan pada tahun 1993 dengan SK Badan Pekerja Harian Gereja Bethel Indonesia (BPH GBI) Pusat No. 119/SU/RNI/93 dan Operasional Depag Kanwil Prop. Maluku No. W.V/SD/PP.00.9/210/95.

Program STPB Ambon Adalah program non gelar, dengan masa studi minimal satu tahun dan pengelolaannya dibawah pengawasan Departemen Pendidikan dan Teologia BPH GBI. Kemudian ditingkatkan menjadi Akademi Teologi Bethel Ambon pada tahun 2007 dengan peserta didik dari interdenominasi gereja.

Dalam upaya meningkatkan layanan dan mutu serta memperhatikan ketentuan Sistem Pendidikan Nasional dan Pendidikan Teologi, maka pada tahun 2009 ditingkatkan menjadi Sekolah Tinggi Teologi Bethel Ambon (STTB Ambon) dengan surat Rekomendasi Depag Kanwil Prop. Maluku No. Kw.25.05/4/KP.00.2/319/2009 dan SK Dirjen Bimas Kristen Kemenag RI No. DJ.III/Kep/HK.005/581/2011.

Status Terakreditasi BAN-PT. No. 3635/SK/BAN-PT/Ak-PPJ/S/VI/2020

Visi

Menjadi Lembaga Pendidikan Tinggi Teologi yang Unggul dalam Penyelenggaraan untuk Menghasilkan Pemimpin Besar Berhati Hamba.

Misi

1. Menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran teologi alkitabiah, sehingga menghasilkan lulusan yang mampu mengaktualisasi diri ditengah masyarakat dan berdayaguna secara efektif.

2. Menyediakan sarana, prasarana dan suasana akademik yang kondusif dalam menciptakan pembelajaran yang berpusat pada mahasiswa (student centred learning) sehingga menghasilkan lulusan terampil, kreatif dan inovatif dalam pelayanan.

3. Menyelenggarakan perkuliahan yang berkualitas untuk menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan dalam memberitakan Injil, merintis, menggembalakan dan memimpin gereja Tuhan dengan berkarakter hamba seperti Kristus.